Shakugan No Shana Season 3 atau dikenal Shakugan no Shana: Season III menceritakan Yuji menghilang pada malam yang menentukan dimana dia seharusnya memilih antara kehidupan melawan kejahatan di sisi Shana atau sebagai remaja normal. Dia kembali dari keadaan hampir mati untuk memimpin Penghuni Crimson dalam rencana yang meragukan untuk membawa perdamaian ke alam semesta, tetapi Shana tidak tertipu. Dalam reuni yang eksplosif, pejuang berapi-api menghadapi musuh yang paling tidak terduga, sementara Flame Hazes dari seluruh dunia bergabung untuk memicu perang yang akan menentukan nasib semua makhluk supernatural.