Di Akademi Hanzo yang terkenal, sekelompok siswa terpilih berlatih secara rahasia untuk menjadi ninja dari klan elit yang dikenal sebagai Master Shinobi. Mengikuti jejak kakeknya, Asuka yang penuh harapan menjalani pelatihan intensif ini bersama teman-temannya yang berbeda: Ikaruga, Katsuragi, Yagyuu, dan Hibari. Tanpa henti mempelajari seni rahasia ninja, mereka mengasah keterampilan mereka dengan harapan suatu hari nanti menjadi ninja wanita seutuhnya. Senran Kagura mengikuti gadis-gadis itu saat mereka bertarung dengan gagah berani melawan kejahatan baru misterius yang meneror Akademi Hanzo. Mengenakan pakaian ketat, mereka harus membuktikan nilai mereka dan melindungi akademi dari musuh sebelum terlambat