Koyomi Araragi, siswa sekolah menengah tahun ketiga, berhasil selamat dari serangan vampir dengan bantuan Meme Oshino, seorang pria aneh yang tinggal di sebuah bangunan yang ditinggalkan. Meskipun telah diselamatkan dari vampir dan sekarang menjadi manusia lagi, beberapa efek samping seperti kemampuan penyembuhan manusia super dan peningkatan penglihatan masih tetap ada. Terlepas dari itu, Araragi mencoba menjalani kehidupan sebagai siswa normal, dengan bantuan temannya dan ketua kelas, Tsubasa Hanekawa. Ketika teman sekelasnya Hitagi Senjougahara jatuh dari tangga dan ditangkap oleh Araragi, anak laki-laki itu menyadari bahwa gadis itu tidak berbobot secara tidak wajar. Meskipun Senjougahara memprotes, Araragi bersikeras dia membantunya, memutuskan untuk meminta bantuan Oshino, orang yang pernah membantunya mengatasi kesulitannya sendiri. Melalui beberapa kisah yang melibatkan setan dan dewa, Bakemonogatari mengikuti Araragi saat ia berupaya membantu mereka yang menderita penyakit supernatural.